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Clase: Dissertação
Título : Polyflow: a Polystore-compliant mechanism to provide interoperability to heterogeneous provenance graphs
Autor(es): Ferreira, Yan Mendes
Orientador: Menezes, Victor Ströele de Andrade
Co-orientador: Oliveira, Daniel de
Miembros Examinadores: Braga, Regina Maria Maciel
Miembros Examinadores: Azevedo, Leonardo
Resumo: Muitos experimentos científicos são modelados como workflows (fluxos de trabalho). Workflows produzem comumente um grande volume de dados. De forma a garantir a reprodutibilidade desses workflows, estes geralmente são orquestrados por Sistemas de Gerência de Workflows (SGWfs), garantindo que dados de proveniência sejam capturados. Dados de proveniência representam o histórico de derivação de um dado ao longo da execução do workflow. Assim, o histórico de derivação dos dados pode ser representado por meio de um grafo de proveniência. Este grafo possibilita aos cientistas analisarem e avaliarem resultados produzidos por um workflow. Todavia, cada SGWf tem seu formato proprietário de representação para dados de proveniência, e os armazenam em diferentes granularidades. Consequentemente, em cenários mais complexos em que um cientista precisa analisar de forma integrada grafos de proveniência gerados por múltiplos workflows, isso se torna desafiador. Primeiramente, para entender o campo de pesquisa, realizamos um Mapeamento Sistemático da Literatura, avaliando soluções existentes sob diferentes lentes. Com uma compreensão mais clara do atual estado da arte, propomos uma ferramenta chamada Polyflow, inspirada em conceitos de sistemas Polystore, possibilitando a integração de várias bases de dados heterogêneas por meio de uma interface de consulta única que utiliza o ProvONE como schema global. Polyflow permite que cientistas submetam consultas em múltiplos grafos de proveniência de maneira integrada. Polyflow foi avaliado em conjunto com especialistas usando dados de proveniência coletados de workflows reais que apoiam o estudo de geração de árvores filogenéticas. O resultado da avaliação mostrou a viabilidade do Polyflow para interoperar semanticamente dados de proveniência gerado por distintos SGWfs, tanto do ponto de vista de desempenho quanto de usabilidade.
Resumen : Many scientific experiments are modeled as workflows. Workflows usually output massive amounts of data. To guarantee the reproducibility of workflows, they are usually orchestrated by Workflow Management Systems (WfMS), that capture provenance data. Provenance represents the lineage of a data fragment throughout its transformations by activities in a workflow. Provenance traces are usually represented as graphs. These graphs allows scientists to analyze and evaluate results produced by a workflow. However, each WfMS has a proprietary format for provenance and do it in different granularity levels. Therefore, in more complex scenarios in which the scientist needs to interpret provenance graphs generated by multiple WfMSs and workflows, a challenge arises. To first understand the research landscape, we conduct a Systematic Literature Mapping, assessing existing solutions under several different lenses. With a clearer understanding of the state of the art, we propose a tool called Polyflow, which is based on the concept of Polystore systems, integrating several databases of heterogeneous origin by adopting a global ProvONE schema. Polyflow allows scientists to query multiple provenance graphs in an integrated way. Polyflow was evaluated by experts using provenance data collected from real experiments that generate phylogenetic trees through workflows. The experiment results suggest that Polyflow is a viable solution for interoperating heterogeneous provenance data generated by different WfMSs, from both a usability and performance standpoint.
Palabras clave : Polystore
Interoperabilidade sintática
Interoperabilidade semântica
Polystore
Syntactic interoperability
Semantic interoperability
CNPq: CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO
Idioma: eng
País: Brasil
Editorial : Universidade Federal de Juiz de Fora (UFJF)
Sigla de la Instituición: UFJF
Departamento: ICE – Instituto de Ciências Exatas
Programa: Programa de Pós-graduação em Ciência da Computação
Clase de Acesso: Acesso Aberto
Attribution 3.0 Brazil
Licenças Creative Commons: http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/br/
URI : https://repositorio.ufjf.br/jspui/handle/ufjf/12302
Fecha de publicación : 13-nov-2020
Aparece en las colecciones: Mestrado em Ciência da Computação (Dissertações)



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